Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP100Q494V2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP100Q494V2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
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