Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ13

WDR72, WD repeat-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR72Q3MJ13 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR72Q3MJ13 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR72Q3MJ13 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR72Q3MJ13 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR72Q3MJ13 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR72Q3MJ13 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR72Q3MJ13 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR72Q3MJ13 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR72Q3MJ13 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms