Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM30BQ3MIR4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM30BQ3MIR4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM30BQ3MIR4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM30BQ3MIR4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM30BQ3MIR4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM30BQ3MIR4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM30BQ3MIR4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms