Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC57Q2TAC2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC57Q2TAC2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC57Q2TAC2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC57Q2TAC2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms