Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KNOP1Q1ED39 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNOP1Q1ED39 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms