Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTGISQ16647 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTGISQ16647 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
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