Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1AQ16623 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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