Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LY6EQ16553 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LY6EQ16553 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LY6EQ16553 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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