Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA3Q16281 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNGA3Q16281 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNGA3Q16281 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
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