Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E2F4Q16254 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F4Q16254 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F4Q16254 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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