Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIP11Q15643 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIP11Q15643 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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