Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDSNQ15517 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDSNQ15517 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDSNQ15517 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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