Protein–RNA interactions for Protein: Q15513

SPHAR, Protein SPHAR, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHARQ15513 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPHARQ15513 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPHARQ15513 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHARQ15513 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHARQ15513 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHARQ15513 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPHARQ15513 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms