Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYTH1Q15438 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTH1Q15438 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms