Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RYR3Q15413 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYR3Q15413 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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