Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC41Q15345 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC41Q15345 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC41Q15345 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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