Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RABEP1Q15276 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RABEP1Q15276 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RABEP1Q15276 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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