Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRKQ15262 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRKQ15262 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRKQ15262 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRKQ15262 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
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