Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM2Q15035 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM2Q15035 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAM2Q15035 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAM2Q15035 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAM2Q15035 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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