Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCLAFQ15004 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCLAFQ15004 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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