Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF3Q14653 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF3Q14653 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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