Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARF1Q14162 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SCARF1Q14162 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCARF1Q14162 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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