Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP5Q14008 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKAP5Q14008 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKAP5Q14008 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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