Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNC3Q14003 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms