Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE7AQ13946 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE7AQ13946 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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