Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DDX39BQ13838 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms