Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA4Q13772 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCOA4Q13772 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA4Q13772 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCOA4Q13772 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms