Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA4Q13439 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA4Q13439 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA4Q13439 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA4Q13439 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA4Q13439 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA4Q13439 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA4Q13439 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA4Q13439 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA4Q13439 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA4Q13439 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms