Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CBX3Q13185 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CBX3Q13185 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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