Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIA1Q13136 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA1Q13136 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA1Q13136 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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