Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF3C1Q12789 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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GTF3C1Q12789 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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GTF3C1Q12789 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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GTF3C1Q12789 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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