Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 SNO2YNL334C 669 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 LEE1YPL054W 906 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RFC5YBR087W 1065 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 CCR4YAL021C 2514 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 OST1YJL002C 1431 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RBS1YDL189W 1374 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RGT2YDL138W 2292 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RPT4YOR259C 1314 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RSM10YDR041W 612 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 DOS2YDR068W 933 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YDR248CYDR248C 582 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 TIM21YGR033C 720 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 TPC1YGR096W 945 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 FLD1YLR404W 858 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YMR253CYMR253C 1245 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YFL040WYFL040W 1623 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 MET1YKR069W 1782 nt7.07□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 UTP7YER082C 1665 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 MET13YGL125W 1803 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 EXG1YLR300W 1347 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 PRP24YMR268C 1335 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 ERR3YMR323W 1314 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 ERR1YOR393W 1314 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 ERR2YPL281C 1314 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YIL177CYIL177C 5277 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 ERD1YDR414C 1089 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YGR149WYGR149W 1299 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 FMP33YJL161W 543 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 UIP3YAR027W 708 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 ATP10YLR393W 840 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YLR400WYLR400W 474 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YMR084WYMR084W 789 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 TPP1YMR156C 717 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 GTO3YMR251W 1101 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 LEM3YNL323W 1245 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 UTP23YOR004W 765 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 SPP381YBR152W 876 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 ERC1YHR032W 1746 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 ALG2YGL065C 1512 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RRN7YJL025W 1545 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RRB1YMR131C 1536 nt7.06□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YER152CYER152C 1332 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 GCD1YOR260W 1737 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 SMB1YER029C 591 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 DSE2YHR143W 978 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 REC107YJR021C 945 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 OPI3YJR073C 621 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 AAT2YLR027C 1257 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 SYM1YLR251W 594 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YLR252WYLR252W 306 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RGS2YOR107W 930 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 ZWF1YNL241C 1518 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 NOP58YOR310C 1536 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 KEI1YDR367W 666 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 WBP1YEL002C 1293 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 BUD25YER014C-A 462 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 NNT1YLR285W 786 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 GGA2YHR108W 1758 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 ECM7YLR443W 1347 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 MAM3YOL060C 2121 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YDR271CYDR271C 372 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 MIG3YER028C 1185 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YGL204CYGL204C 306 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 IMO32YGR031W 1029 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YGR160WYGR160W 612 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 DMA1YHR115C 1251 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RPL40BYKR094C 387 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YLR111WYLR111W 333 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 RHO5YNL180C 996 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YOL029CYOL029C 606 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 YOR314WYOR314W 330 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 HXT3YDR345C 1704 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 CDC40YDR364C 1368 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 MSG5YNL053W 1470 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 VTS1YOR359W 1572 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 GAS2YLR343W 1668 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-BRQ12217 MAS2YHR024C 1449 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YHR202WYHR202W 1809 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 VRG4YGL225W 1014 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 THG1YGR024C 714 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YJL055WYJL055W 738 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 PIR3YKL163W 978 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 YKR047WYKR047W 306 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 MRS4YKR052C 915 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 ADH6YMR318C 1083 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 RIB4YOL143C 510 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 ATX2YOR079C 942 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 RIB5YBR256C 717 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 RNY1YPL123C 1305 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 SHC1YER096W 1539 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 SNU66YOR308C 1764 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 AIM7YDR063W 450 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 PMU1YKL128C 888 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 CAF20YOR276W 486 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 SEC62YPL094C 825 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 CDC13YDL220C 2775 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-BRQ12217 SGF73YGL066W 1974 nt7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.3 ms