Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC173Q0VFZ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC173Q0VFZ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC173Q0VFZ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms