Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYCNQ0VAF6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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