Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 YGL152CYGL152C 678 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 YGR153WYGR153W 654 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 TRX2YGR209C 315 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 MDY2YOL111C 639 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 YPL071CYPL071C 471 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 KRE6YPR159W 2163 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 ROT2YBR229C 2865 nt5.53□□□□□ -1.52
CTI6Q08923 STE12YHR084W 2067 nt5.52□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 CPS1YJL172W 1731 nt5.52□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 AAP1YHR047C 2571 nt5.52□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 AAD4YDL243C 990 nt5.52□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 AUA1YFL010W-A 285 nt5.52□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YKL107WYKL107W 930 nt5.52□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 CBF5YLR175W 1452 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YMD8YML038C 1329 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 TUB3YML124C 1338 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YMR196WYMR196W 3267 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 IML2YJL082W 2196 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 MHF2YDL160C-A 243 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 DPB4YDR121W 591 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 SKI6YGR195W 741 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YPL014WYPL014W 1146 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 OCA5YHL029C 2040 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 GIP2YER054C 1647 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 FAP1YNL023C 2898 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 TAH18YPR048W 1872 nt5.51□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 GAD1YMR250W 1758 nt5.5□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 SDA1YGR245C 2304 nt5.5□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YFT2YDR319C 825 nt5.5□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YDR417CYDR417C 372 nt5.5□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 PDE1YGL248W 1110 nt5.5□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 MNT2YGL257C 1677 nt5.5□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 MPP10YJR002W 1782 nt5.5□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 CLD1YGR110W 1338 nt5.49□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 ATG1YGL180W 2694 nt5.49□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 SFK1YKL051W 1062 nt5.49□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 GTR1YML121W 933 nt5.49□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 GSP2YOR185C 663 nt5.49□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YOR292CYOR292C 930 nt5.49□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 SUP35YDR172W 2058 nt5.49□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 SPO77YLR341W 1434 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 ALG6YOR002W 1635 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 IMG2YCR071C 441 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 MTM1YGR257C 1101 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 PHO86YJL117W 936 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 PPG1YNR032W 1107 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YOR379CYOR379C 339 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 GDH2YDL215C 3279 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 CTS2YDR371W 1536 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YHR182WYHR182W 2358 nt5.48□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 EIS1YMR031C 2532 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 RIM15YFL033C 5313 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 ATG32YIL146C 1590 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 YNL095CYNL095C 1929 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 PRO2YOR323C 1371 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 UBC6YER100W 753 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 MMS2YGL087C 414 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 RPL19AYBR084C-A 570 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 MAL13YGR288W 1422 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 TSL1YML100W 3297 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 HOF1YMR032W 2010 nt5.47□□□□□ -1.53
CTI6Q08923 MET12YPL023C 1974 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 RSM10YDR041W 612 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 AIM7YDR063W 450 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 SNM1YDR478W 597 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 YEL028WYEL028W 462 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 SKI8YGL213C 1194 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 FRA2YGL220W 363 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 FMP48YGR052W 1110 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 YGR066CYGR066C 879 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 DSE3YOR264W 1293 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 FAT3YKL187C 2253 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 GIP1YBR045C 1920 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 BUD22YMR014W 1560 nt5.46□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 RKM4YDR257C 1485 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 DCD1YHR144C 939 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 YIL165CYIL165C 360 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 NOP13YNL175C 1212 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 SNF8YPL002C 702 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 RER1YCL001W 567 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 RTC1YOL138C 4026 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 EXO1YOR033C 2109 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 PWP1YLR196W 1731 nt5.45□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 RPS16BYDL083C 432 nt5.44□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 RCR2YDR003W 633 nt5.44□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 BUD16YEL029C 939 nt5.44□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.44□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 NMD3YHR170W 1557 nt5.44□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 RPS4BYHR203C 786 nt5.44□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 RPS4AYJR145C 786 nt5.44□□□□□ -1.54
CTI6Q08923 DSC2YOL073C 969 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.9 ms