Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACTN3Q08043 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTN3Q08043 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN3Q08043 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms