Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL18Q07020 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPL18Q07020 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPL18Q07020 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms