Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR3Q06889 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR3Q06889 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms