Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD51Q06609 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAD51Q06609 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51Q06609 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms