Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR4Q05215 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR4Q05215 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms