Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTPN12Q05209 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN12Q05209 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms