Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CD164Q04900 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD164Q04900 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD164Q04900 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD164Q04900 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CD164Q04900 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CD164Q04900 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD164Q04900 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD164Q04900 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms