Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX1Q04741 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
EMX1Q04741 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX1Q04741 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX1Q04741 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX1Q04741 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX1Q04741 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX1Q04741 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX1Q04741 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX1Q04741 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX1Q04741 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX1Q04741 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms