Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 ATG18YFR021W 1503 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 URA7YBL039C 1740 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 GSY1YFR015C 2127 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 FRA2YGL220W 363 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 LOH1YJL038C 660 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 TVP38YKR088C 1014 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 ECM2YBR065C 1095 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 RER1YCL001W 567 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 IMA3YIL172C 1770 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 IMA4YJL221C 1770 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 GUS1YGL245W 2127 nt5.29□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 HOF1YMR032W 2010 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 PER1YCR044C 1074 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 YJL211CYJL211C 444 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 RRN9YMR270C 1098 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 MPP10YJR002W 1782 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 JHD2YJR119C 2187 nt5.28□□□□□ -1.56
CSI1Q04368 YMD8YML038C 1329 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 HXT5YHR096C 1779 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 RPS16BYDL083C 432 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 HXT7YDR342C 1713 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 HXT6YDR343C 1713 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 GPP1YIL053W 753 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 FMP46YKR049C 402 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 ATG17YLR423C 1254 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 PEX29YDR479C 1665 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 STB3YDR169C 1542 nt5.27□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 GDH2YDL215C 3279 nt5.26□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt5.26□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 PDX3YBR035C 687 nt5.26□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 snR32snR32 188 nt5.26□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 TDA7YNL176C 1911 nt5.26□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 NUP2YLR335W 2163 nt5.26□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 EXO1YOR033C 2109 nt5.26□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 MET4YNL103W 2019 nt5.25□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 snR7-SsnR7-S 179 nt5.25□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 COQ4YDR204W 1008 nt5.25□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 URA3YEL021W 804 nt5.25□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.25□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 ARN1YHL040C 1884 nt5.25□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 CYK3YDL117W 2658 nt5.24□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 TAF10YDR167W 621 nt5.24□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 YHR145CYHR145C 357 nt5.24□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 TEF4YKL081W 1239 nt5.24□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 GCR1YPL075W 2358 nt5.24□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 APM4YOL062C 1476 nt5.24□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 PRD1YCL057W 2139 nt5.24□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 GAS3YMR215W 1575 nt5.24□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 THS1YIL078W 2205 nt5.24□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 RAD53YPL153C 2466 nt5.23□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 CKA2YOR061W 1020 nt5.23□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 RAD57YDR004W 1383 nt5.23□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 PMT2YAL023C 2280 nt5.23□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 RAD52YML032C 1416 nt5.23□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 CTT1YGR088W 1689 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 YDR056CYDR056C 618 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 KRE28YDR532C 1158 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 BUD13YGL174W 801 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 CNB1YKL190W 528 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 SKG1YKR100C 1068 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 YLR407WYLR407W 687 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 REC114YMR133W 1287 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 SUA7YPR086W 1038 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 APE1YKL103C 1545 nt5.22□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 MCX1YBR227C 1563 nt5.21□□□□□ -1.57
CSI1Q04368 API2YDR525W 330 nt5.21□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.21□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 CDC42YLR229C 576 nt5.21□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 YBL010CYBL010C 843 nt5.21□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 SUL2YLR092W 2682 nt5.21□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 CLF1YLR117C 2064 nt5.2□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 DBF2YGR092W 1719 nt5.2□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 AIM7YDR063W 450 nt5.2□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 YNL194CYNL194C 906 nt5.2□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 HIS4YCL030C 2400 nt5.2□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 BUD14YAR014C 2130 nt5.2□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 RXT3YDL076C 885 nt5.19□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 NUP42YDR192C 1293 nt5.19□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 CBT1YKL208W 816 nt5.19□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 FRT2YAL028W 1587 nt5.19□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 PEX7YDR142C 1128 nt5.18□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 PHM8YER037W 966 nt5.18□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt5.18□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt5.18□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt5.18□□□□□ -1.58
CSI1Q04368 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt5.18□□□□□ -1.58
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