Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A11Q02978 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A11Q02978 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC25A11Q02978 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC25A11Q02978 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC25A11Q02978 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms