Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC3AQ02505 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC3AQ02505 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC3AQ02505 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms