Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG1Q02413 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG1Q02413 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG1Q02413 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.5 ms