Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNC1Q01954 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNC1Q01954 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BNC1Q01954 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms