Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1DQ01668 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1DQ01668 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms