Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFAMQ00059 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TFAMQ00059 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFAMQ00059 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms